Мужчина говорит, что сдал анализ за 72 часа до вылета, по всем правилам, но получив справку, испугался, что пограничники в Египте посчитают срок не в его пользу.
- ПЦР-тест перед вылетом: как не лишиться отпуска из-за неправильной справки
- Какие существуют экспресс-тесты на COVID-19
- ПЦР-тесты
- Тесты на антиген
- Туристы начали массово подделывать ПЦР-тесты
- Кто должен подать сведения о результатах анализа на COVID 19
- Можно ли самому распечатать пцр тест
- Разбираемся в особенностях каждого варианта.
- В аптеках продают экспресс-тесты для домашнего исследования, основанные на определении наличия антигена SARS-CoV-2 (от 1800₽) и экспресс-тесты на антитела к коронавирусу IgG/IgM (от 1300₽). Результаты пригодятся только для личного использования.
- Почему ПЦР-тесты не выявляют COVID-19: на какой день заболевания коронавирусом надо делать тест
- "Цена ошибки высока". От чего зависит результат ПЦР-тестов на коронавирус
- Как выявляют вирус в организме
- Тонкости метода
- О точности диагностики
- Альтернатива ПЦР-диагностике
ПЦР-тест перед вылетом: как не лишиться отпуска из-за неправильной справки
Некоторые страны в этом году готовы принимать российских туристов, привитых против коронавируса или способных подтвердить, что они не больны COVID-19. Для этого перед поездкой нужно сдать ПЦР-тест, но здесь могут возникнуть сложности.
“Стоит дата – 18.01. Результат негативный. Но времени никакого нет вообще”, – рассказал Александр Каменский, который из-за отсутствия нужной информации в справке едва не лишился отдыха в Египте.
Мужчина говорит, что сдал анализ за 72 часа до вылета, по всем правилам, но получив справку, испугался, что пограничники в Египте посчитают срок не в его пользу.
“Результат отрицательный, но времени нету. Соответственно, понятно, что отсчет производится от нуля часов. А я на это абсолютно не рассчитывал. Я сдал анализ в 16 часов”, – пояснил Александр.
Он не скрывает: чтобы избежать проблем, пришлось самому добавить время в справку. И, судя по туристическим форумам, в такие недоразумения попадают сотни россиян. По словам Ираиды Шерстневой из Уфы, три дня назад улететь на лечение в Израиль не смогли ее муж с ребенком. Все из-за справок в смартфоне.
“При посадке в самолет оказалось недостаточно иметь электронную версию. Нужно было иметь распечатанную. Соответственно, за 5 минут до посадки в самолет это сделать было нереально”, – рассказала Шерстнева.
Итог – потерянные деньги и сорванные планы. Сами же перевозчики разводят руками: они лишь выполняют требования других государств.
“Как правило, за границей требуют ПЦР-тесты в распечатанном виде, но в некоторых странах, таких как Иран, Латвия, Мальдивы, США и в некоторых других допускается предъявление ПЦР-теста в электронном виде”, – пояснила пресс-секретарь ПАО “Аэрофлот” Юлия Спивакова.
А еще справки должны быть на английском языке и только от лабораторий, аккредитованных Роспотребнадзором. Тем же, кто по каким-то причинам рискует не улететь, последний шанс дают в столичных аэропортах. В лабораториях, организованных вместе с Российским фондом прямых инвестиций (РФПИ), получить результат можно всего за полтора часа.
“Мы стараемся войти в положение каждого. И, как можем, максимально ускорить процесс, когда действительно, грубо говоря, “горит”. Быстро поднять пробку наверх в лабораторию и сделать как можно быстрее”, – сказал руководитель подразделения коммерческой клиники, организовавшей сдачу анализов в аэропортах, Артем Бобков.
Бывает, что ПЦР-анализы требуют и на обратном пути, если рейс транзитный. Об этом не знала пермячка Алена Ковалева, когда возвращалась из Египта с пересадкой в Стамбуле. Билеты купила у разных авиакомпаний, а нужно было – у одной и той же. Чтобы вылететь без теста, пришлось отдать еще 20 тысяч рублей.
“Нужно было купить билеты именно от этой авиакомпании, чтобы она увидела в своей системе наш путь. То есть, то, что мы летим из Египта транзитом через Турцию в Россию. А иначе, к сожалению, они нас не готовы были в принципе допустить до посадки”, – рассказала Ковалева.
И все же повысить шансы на счастливый отпуск можно, если изучить подводные камни заранее.
“К сожалению, мы вынуждены констатировать, что правила игры вот на этой площадке, если можно так выразиться, сегодня мировым сообществом только определяются. В лучшем случае это будет, может быть, к началу лета. Или летом текущего года”, – говорит директор ассоциации “Турпомощь” Александр Осауленко.
Пока нет единых правил нет, туристам остается одно: отнестись к медицинской справке как к самому важному документу в своем турпакете и сделать все точно по инструкции, которую публикуют сразу три заинтересованные стороны: авиакомпания, страна прилета и страна транзита.
В ходе исследования также выяснили, какие тесты на антигены дают самые точные результаты. Ученые проанализировали самые популярные и доступные к продаже образцы [2]. В ходе эксперимента PBCheck Covid 19 Ag показал лучшие результаты в сравнении с аналогами [3]. У этого теста высокая точность — 88,5%. При этом этот показатель у тестов Panbio Covid-19 Ag Rapid Test составил 87%, а у Standard Q и BD Veritor — 87,2%.
Какие существуют экспресс-тесты на COVID-19
Сегодня наличие SARS-CoV-2 — вируса, вызывающего COVID-19, определяют при помощи двух методик:
ПЦР-тесты
ПЦР или полимеразная цепная реакция — это метод молекулярной диагностики. Он обнаруживают РНК вируса в организме и позволяет узнать, болен ли человек в данный момент или является носителем. Точность этого метода довольно высокая и составляет почти 100%. Но на конечный результат анализа влияет тщательная подготовка материала.
ПЦР-тесты на коронавирус (RT-PCR) нужно обязательно сдавать тем, кто вернулся из-за границы, имел контакты с больными коронавирусом, а также пациентам с диагнозом «внебольничная пневмония», ОРВИ и грипп, сотрудникам медучреждений и людям старше 65 лет — они находятся в группе риска.
Сделать ПЦР-тест можно в государственной поликлинике (при наличии полиса ОМС) и в частных лабораториях. Важное условие — отсутствие явных признаков простуды и контактов с больными в последние несколько дней. Для проведения теста на COVID-19 биологический материал из ротоглотки и полости носа берут амбулаторно либо специалист может выехать на дом. Затем его исследуют в лаборатории с помощью специального оборудования, ждать результатов нужно не менее 24 часов.
Тесты на антиген
Тесты на антигены (RAT) выявляют белки вируса. При помощи небольших одноразовых пластиковых кассет определяют наличие генетического материала вируса аналогично лабораторным методам. Преимущество этого способа в том, что исследование проводится с помощью небольших приборов, которые легко транспортировать и устанавливать вне специализированной лаборатории. В этом случае также исследуют образцы из носа или горла. Анализ основывается на обнаружении антигена вируса и занимает от 5 до 30 минут.
Первые тест-системы давали высокую погрешность, однако современные модели тестов сегодня достаточно точны. При правильном соблюдении порядка сдачи анализов достоверность результатов составляет более 80%.
Сегодня экспресс-тестирование считается удобным и быстрым способом определить наличие вируса в организме. Тест-системы применяются в аэропортах, вокзалах, на крупных предприятиях и в медицинских учреждениях. Анализ требует минимальной подготовки и значительно дешевле ПЦР-тестирования.
«В экспресс-тесте мы определяем сам коронавирус (правильнее говорить “антиген коронавируса”), а в ПЦР-тесте мы определяем его молекулярную структуру. Причем при создании тест-систем в методе ПЦР мы используем те участки молекулы коронавируса, которые не были подвержены мутациям. То есть они одинаковы для всех известных штаммов ковида: “Дельта”, “Омикрон”, “Альфа”, уханьский штамм и любые другие. Метод ПЦР выявляет все виды коронавируса. Даже на ранней стадии», — рассказывает Тиванова.
Для ПЦР – и для экспресс-тестов на ковид используются биоматериалы, взятые из верхних дыхательных путей — это мазок из носоглотки и мазок из зева (горла).
«Кровь как биоматериал не используется для скрининговых тестов. Потому что коронавирус мы определяем в верхних дыхательных путях. Но если, например, пациент находится в стационаре, в тяжелом состоянии, то в качестве биоматериала медики действительно используют кровь, чтобы понять, есть ли в ней вирус. Кровь используется только для исследования ПЦР-методом», — объяснила Елена Тиванова.
А вот для определения уровня антител (иммунитета к ковиду) в качестве биоматериала берут только кровь. Для экспресс-теста можно сдать кровь из пальца, а вот ПЦР-тесты для определения антител не используются. Для этого существуют другие лабораторные методы. Например, иммуноферментный анализ (кратко он называется ИФА). Это способ обнаружения в крови специфических антител с помощью разных биохимических реакций.
«Мы определяем иммунный ответ организма на коронавирус, а не сам коронавирус, поэтому исследуется кровь. Что касается результатов тестирования, то сравнивая результаты экспресс-теста и ИФА, можно сказать, что чувствительность экспресс-метода обычно несколько ниже. Поэтому антитела, которые мы определим лабораторно, — это более точный анализ. Поскольку он покажет не только наличие антител, но и их количество», — резюмировала Елена Тиванова.
Именно поэтому, руководствуясь принципами экономии, туристы могут прибегнуть к массовой подделке тестов.
Туристы начали массово подделывать ПЦР-тесты
Из-за массового внедрения ПЦР-тестов существует риск их подделок. На это уже обратили внимание в Великобритании.
Как данным издания The Sun, согласно утвержденным требованиям, каждый, кто возвращается в Великобританию, должен предоставить отрицательный ПЦР-тест на коронавирус, сделанный ранее, чем за 72 часа до поездки. Учитывая достаточно высокую стоимость тестов – от 100 до 300 фунтов стерлингов в зависимости от клиники, становится очевидно, что для семьи такая проверка может обернуться весьма существенными затратами.
Именно поэтому, руководствуясь принципами экономии, туристы могут прибегнуть к массовой подделке тестов.
Впрочем, уже известны случаи подделки тестов. Наиболее простой вариант для подделки представляют собой электронные версии тестов, которые можно без проблем отредактировать не только в Photoshop, но даже самом простом графическом редакторе.
Предприимчивые туристы таким способом меняют в тестах имя и дату, что дает им возможность не оплачивать исследование. Также существует информация о том, что даже некоторые турагентства в последнее время грешат подобными делами.
При этом за подделку тестов пока по сути не предусмотрено никакой ответственности, максимум, что грозит человеку, решившемуся на редактирование текста, это арест, а минимум – отказ пустить его на борт.
Масштабы подделок можно оценить по цифрам. Например, задержаны около 40 туристов, пытавшихся въехать в Хорватию через сухопутную границу с поддельными тестами. При этом в мире постоянно увеличивается число стран, где для пересечения границы необходимо предъявить отрицательный тест на коронавирус.
Прохождение теста и загрузка отчета о его результатах – очень важное действие, которое контролируется государством. Если не загрузить тест вовремя или пренебречь этой процедурой, то гражданина ждут большие штрафы.
Кто должен подать сведения о результатах анализа на COVID 19
После массового привоза нового типа вируса из зарубежных стран, Правительство вплотную занялось этим вопросом. Необходимо было контролировать ситуацию и не допускать распространения ковида туристами и лицами, которые возвращаются из других стран.
Поэтому было вынесено Постановление Главного государственного санитарного врача РФ 22 от 27.07.2020 г. Оно обязывает всех граждан России, которые прибывают в Россию из-за рубежа любым транспортом, сдать два теста на коронавирус. Результаты передаются в Роспотребнадзор через Госуслуги.
С 1 мая 2021 г. граждане РФ должны сдавать два теста на ковид после прибытия из-за границы. Необходимо соблюдать следующий порядок действий:
Первый тест сдается в течение трех дней после даты прибытия, включая эту дату. Результат загружается на госуслуги. Пока не будет получен отрицательный тест, необходимо оставаться на самоизоляции. Второй тест сдается в течение пяти дней. Он должен быть сдан не ранее, чем через сутки после сдачи первого. Результат снова загружается на портал.
Тесты сдаются сразу после прибытия в Россию. Данные правила действуют и в 2021 году. Так как вирус продолжает распространяться по всему миру, требование по сдаче теста сохраняется до сих пор. Эти правила не касаются сотрудников авиакомпаний, которые задействованы в процессе перелета.
ПЦР-тест возможно сдать непосредственно в аэропорту. В каждом организованы специальные пункты по забору мазков и сдаче анализов на ковид. Результаты выдаются в течение одного-двух часов. Гражданин, который прибыл из-за границы, может сразу дождаться результатов теста. Результаты выдаются на бумаге и в pdf-формате. Файл можно загрузить с телефона, компьютера или ноутбука. Если результат отрицательный, то гражданин может свободно перемещаться в любом направлении.
Если результат окажется положительным, то необходимо отправить его по стандартной схеме, а затем оставаться на самоизоляции и вызвать участкового врача. Сведения о наличии коронавируса Роспотребнадзор сообщает в поликлинику по месту жительства. На весь период болезни гражданин получает больничный лист. Человека выписывают, когда получены два отрицательных теста на ковид с интервалом в два дня.
Перед тем как сдать результаты теста, необходимо сообщить о своем прибытии на территорию РФ. Лучше сделать это сразу при покупке билета. Для этого требуется зайти на сайт Госуслуг. Найти услугу «Регистрация прибывающих в РФ». На данной странице нажать кнопку «Заполнить анкету». Затем открывается форма, которую необходимо заполнить данными:
- автоматически вносятся данные: ФИО, дата рождения, пол, гражданство; загрузка фотографии. Вид фото должен быть как на паспорт; адрес регистрации и места жительства; паспортные данные (подставляются автоматически); номер полиса ОМС; откуда прибытие, когда прилёт в РФ, аэропорт прибытия, номер рейса, конечный пункт прибытия; присутствуют ли симптомы заболевания; информация о детях, которые прибывают вместе с заявителем.
Затем гражданин ставит галочку о том, что он ознакомлен с тем, что по приезду он обязан в течение трех дней пройти тест на ковид и загрузить его на Госуслугах.
На обратном пути в транспорте гражданину передается анкета для заполнения в печатной форме. Ее необходимо отдать сотрудникам Роспотребнадзора, которые встречают пассажиров после прохождения паспортного контроля.
Коронавирус тропен к эпителиальным клеткам легких, желудка и кишечника. Поскольку чаще всего “входными воротами” инфекции служат дыхательные пути, то вирус приводит к развитию респираторных симптомов. У большинства заболевших инфекция протекает в легкой форме, носящей симптомы ОРВИ. В группе риска пожилые люди, курильщики и люди с хроническими заболеваниями. У них коронавирусная инфекция может протекать с развитием тяжелой пневмонии и респираторного дистресс-синдрома. У детей заболевание чаще всего протекает в легкой форме.
Можно ли самому распечатать пцр тест
Исследование для выявления коронавируса SARS-CoV-2, которое позволяет с помощью метода полимеразной цепной реакции определить генетический материал (РНК) вируса в образце биоматериала.
COVID-19 PCR test, 2019-nCoV PCR, RNA [polymerase chain reaction, PCR].
Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР).
Аналитическая чувствительность тест-системы – 5*10^2 копий (1*10^5 копий/мл).
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Коронавирусы – это РНКсодержащие вирусы, на сегодняшний день известно 40 видов. В конце 2019 года был выявлен новый штамм коронавируса – SARS-CoV-2, который вызывает коронавирусную инфекцию COVID-19.
Коронавирусы названы в честь короноподобных шипов на поверхности вируса. У коронавируса SARS-CoV-2 выделяют два подтипа: S и L. S-подтип – более ранний, был сфокусирован в Ухани, вызывает более тяжелое течение заболевание, а L – поздний штамм, распространился по всему миру.
Вирус передается от человека человеку воздушно-капельным, воздушно-пылевым и контактным путем, через рукопожатия и поверхности предметов, на которых он может существовать определенное время. Инкубационный период – до 14 дней, в среднем симптомы появляются на 5-6-е сутки.
Коронавирус тропен к эпителиальным клеткам легких, желудка и кишечника. Поскольку чаще всего “входными воротами” инфекции служат дыхательные пути, то вирус приводит к развитию респираторных симптомов. У большинства заболевших инфекция протекает в легкой форме, носящей симптомы ОРВИ. В группе риска пожилые люди, курильщики и люди с хроническими заболеваниями. У них коронавирусная инфекция может протекать с развитием тяжелой пневмонии и респираторного дистресс-синдрома. У детей заболевание чаще всего протекает в легкой форме.
Молодые люди и дети могут переносить инфекцию бессимптомно, что способствует распространению COVID-19 среди населения.
Реже заболевание проявляется диареей, тошнотой и рвотой.
Диагностика коронавирусной инфекции проводится при помощи метода ПЦР, который позволяет выявить генетический материал вируса в организме.
- Для скрининга условно здорового населения. При наличии симптомов заболевания. Прибывшим из стран с опасной эпидемиологической ситуацией по коронавирусной инфекции. При наличии контактов с людьми, у которых лабораторно подтвержден COVID-19, или с теми, кто прибыл из стран с высоким уровнем распространения COVID-19.
Все пациенты, прибывшие из стран с высоким уровнем распространения COVID-19 или контактировавшие с прибывшими оттуда, а также пациенты с повышенной температурой тела и/или явными симптомами ОРВИ будут направляться для обследования согласно рекомендациям Роспотребнадзора.
Зависит от страны. Вот информация по самым популярным направлениям:
Если не так давно основным требованием въезда был отрицательный результат ПЦР-теста, то сейчас есть несколько вариантов:
- по-прежнему, с ПЦР-тестом, вакцинированные туристы утвержденным списком вакцин и предоставивших подтверждение. Уже пускают или объявили об этом – Греция, Грузия, Кипр, Черногория, Шри-Ланка и Сейшелы. переболевших туристов с документом, подтверждающим, что пассажир перенес COVID-19. Такой вариант есть для желающие въехать в США. Греция также готова принимать путешественников при наличии справки о наличии антител.
Разбираемся в особенностях каждого варианта.
ПЦР-тест (Метод полимеразной цепной реакции)
Самый распространенный и надежный вариант тестирования. Материал берется специальными зондами из носа и рта. В среднем будет готов через 24 часа, иногда указывают 2-3 дня. Основная задача теста – ответить на главный вопрос: заражен человек или нет прямо сейчас. Позволяет определить болезнь даже при отсутствии клинических признаков.
Тест на антитела класса М (IgM) и G (IgG)
Отличается от теста ПЦР тем, что для исследования берут кровь, а не слюну. Основная задача теста – определить перенес ли человек инфекцию или нет, т. к. антитела остаются в организме даже после выздоровления. Для путешествий и пересечения границ обычно не применяется.
Тест на антигены SARS-CoV-2 или как его могут указывать «экспресс-тест»
Для анализа берут мазки из горла и носа, причем за 3 часа до процедуры нельзя есть, пить, курить, чистить зубы. Результаты будут готовы через 30 минут. Этот метод позволяет диагностировать COVID-19 на ранних стадиях заболевания. Однако есть подозрения на заражение именно коронавирусом – рекомендуется сдать ПЦР-тест.
В аптеках продают экспресс-тесты для домашнего исследования, основанные на определении наличия антигена SARS-CoV-2 (от 1800₽) и экспресс-тесты на антитела к коронавирусу IgG/IgM (от 1300₽). Результаты пригодятся только для личного использования.
Точность тестирования снижается и от того, что среди заболевших появляются вакцинированные люди. Они выделяют вирус в меньшем количестве и не такое продолжительное время, считает замдиректора Московского НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Г. Н. Габричевского Татьяна Руженцова.
Почему ПЦР-тесты не выявляют COVID-19: на какой день заболевания коронавирусом надо делать тест
ПЦР-тест точнее всего определяет COVID-19 на третий-пятый день с момента появления симптомов, а экспресс-тест на антиген можно делать с первого дня. После 5-7 дней концентрация вируса в выделениях человека резко снижается, что ведёт к ложноотрицательным результатам тестов. В России ошибки ПЦР-тестов достигают 30 % случаев.
Единственным способом диагностики коронавируса остаётся ПЦР-тестирование. Но в России сбой дают 30 % тестов на COVID-19, по статистике Минздрава. Неточность грозит тем, что люди с ложноотрицательными результатами не соблюдают режим самоизоляции и заражают других.
Точнее всего результаты теста на COVID-19 на третий день после появления первых симптомов. В первые дни после инфицирования концентрация вируса в организме ещё слишком мала, чтобы это определил анализ, а через неделю-две иммунная система уже убивает SARS-CoV-2.
«После четвёртого-пятого дня болезни вероятность обнаружить вирус в носоглотке снижается, а респираторные симптомы могут быть в это время в самом разгаре. Если проводить тестирование в эти сроки, то можно получить отрицательный результат», – приводит слова заместителя директора по клинико-аналитической работе ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, профессора Натальи Пшеничной РИА Новости.
Точность тестирования снижается и от того, что среди заболевших появляются вакцинированные люди. Они выделяют вирус в меньшем количестве и не такое продолжительное время, считает замдиректора Московского НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Г. Н. Габричевского Татьяна Руженцова.
ПЦР-тест будет наиболее точен на третий-пятый день с момента появления симптомов коронавируса, а экспресс-тест на антиген можно делать с первого дня появления симптомов и до пятого-седьмого дня, после этого концентрация вируса будет резко снижаться. Об этом рассказал главный врач Центра диагностики и лечения им. Н. А. Семашко Заур Жилоков «Российской газете».
Для увеличения точности анализа врач рекомендует за три часа до сдачи теста не пить, не есть, не полоскать горло и не пользоваться какими-либо спреями и каплями.
Напомним, в декабре 2021 года в одном из ТРЦ Новосибирска появился первый автомат с экспресс-тестами на коронавирусную инфекцию. А в аптеках Новосибирска экспресс-тесты, определяющие наличие антител к коронавирусу за четверть часа, появились ещё год назад.
“Тяжело заболел наш сотрудник. Поднялась высокая температура, положили в больницу. Все признаки COVID-19, — рассказывает Алексей Чемерис, доктор биологических наук, профессор, сотрудник Института биохимии и генетики Уфимского ФИЦ РАН. — А ПЦР-анализ, который ему сделали в специальном медицинском центре наши коллеги-профессионалы, как только он почувствовал недомогание, — отрицательный. Видимо, в тот момент у больного было мало вирусных частиц в организме — за пределами чувствительности теста”.
"Цена ошибки высока". От чего зависит результат ПЦР-тестов на коронавирус
МОСКВА, 6 дек — РИА Новости, Татьяна Пичугина. Недавняя публикация ученых из Сеченовского университета о том, что почти половина анализов на возбудителя COVID-19 не дают реальной картины, вызвала множество вопросов. Насколько точны ПЦР-тесты и нужны ли они для диагноза? РИА Новости разбирается в ПЦР-диагностике и почему в нее закрадываются ошибки.
Как выявляют вирус в организме
“Тяжело заболел наш сотрудник. Поднялась высокая температура, положили в больницу. Все признаки COVID-19, — рассказывает Алексей Чемерис, доктор биологических наук, профессор, сотрудник Института биохимии и генетики Уфимского ФИЦ РАН. — А ПЦР-анализ, который ему сделали в специальном медицинском центре наши коллеги-профессионалы, как только он почувствовал недомогание, — отрицательный. Видимо, в тот момент у больного было мало вирусных частиц в организме — за пределами чувствительности теста”.
Ученые называют такие результаты ложнонегативными — инфекция проявляется внешне, а тест на возбудителя — “чистый”. Тут дело и в самом методе, и в его массовом применении.
Когда медсестра берет мазок из ротоглотки и носоглотки, на кончике зонда остается немного влаги, а в ней — клетки эпителия. Зонд опускают в пластиковую пробирку с раствором (эппендорф) и кончик отламывают, чтобы закрыть емкость. В лаборатории ее помещают в центрифугу, проводят ряд манипуляций для выделения из клеток фрагментов вирусного генома. В случае с COVID-19 — это РНК коронавируса SARS-CoV-2.
В образовавшийся раствор добавляют праймеры — искусственные участки генома коронавируса, именно они опознают SARS-CoV-2, и один из них служит затравкой для синтеза цепочки ДНК под действием определенного фермента на основе механизма обратной транскрипции. Фактически получается ДНК-копия участка коронавируса, которую уже можно размножать. Для этого запускают ПЦР — полимеразную цепную реакцию. За несколько десятков циклов она увеличивает число копий ДНК, а специальный флуоресцентный краситель подсвечивает их в пробирке, сигнализируя о вирусе. Если в биоматериале нет вирусных частиц, ампликонов (продуктов ПЦР) не будет вовсе, результат — отрицательный. Если вируса очень мало, итоговое количество ампликонов по завершении ПЦР окажется за пределами чувствительности прибора и результат — ложноотрицательным.
Тонкости метода
В ПЦР-диагностике много нюансов, объясняет Алексей Чемерис. В лаборатории для научных целей выявляют даже единичные копии вирусного генома в образце, при массовом применении чувствительность обычно на порядки ниже.
“Из-за случайных мутаций генома праймеры могут не сработать, если однонуклеотидные замены или даже более значительные изменения генома вируса пришлись как раз на эти участки. Вероятность невысока, но она есть”, — отмечает ученый.
Возможны сбои при ручных операциях, которых не так много. Одна из них — извлечение вирусной РНК из образца. Автоматический экстрактор нуклеиновых кислот стоит довольно дорого, поэтому обычно эту процедуру доверяют лаборанту. Редко, но ложноположительные результаты случаются, в том числе из-за особенностей ПЦР или загрязнения образца.
Чаще всего, однако, проблемы возникают до того, как пробирка попала в лабораторию. Вот что Пишут авторы статьи в журнале “Вестник Росздравнадзора”: “В настоящее время имеются неопровержимые доказательства того, что преаналитическая фаза является основным источником ошибок в лабораторных исследованиях, когда они используются для диагностических или исследовательских целей”. Они публикуют целый список нарушений, ведущих к ложноотрицательным результатам.
Ключевой этап — подготовка к исследованию. “За три часа до анализа нельзя есть, пить, курить и полоскать рот. Дело в том, что коронавирус поражает клетки слизистой оболочки дыхательных путей. Проникая в них, он начинает размножаться, накапливается на их поверхности. Но есть еще и эпителиальные клетки, которые часто обновляются. Вместе с водой, едой и избытком слюны при курении и жевании жвачки эпителиальные клетки попадают в пищевод. В результате вероятность обнаружить вирус в мазке падает практически до нуля”, — комментирует Тамара Силкина, врач клинической лабораторной диагностики, директор по лабораторным технологиям “Гемотеста”.
Не менее важна процедура взятия биоматериала. Если неверно выбрать точку для мазка, например, из-за кашля или рвотного рефлекса, на зонд может не попасть достаточное количество клеток. На результат также влияют нарушения технологии хранения, транспортировки образцов.
“Цена ошибки очень высока — процент выявляемости коронавирусной инфекции снизится, а скорость ее распространения вырастет. Люди, получившие ложноотрицательные результаты, будут чувствовать себя спокойно, выходить в общественные места и контактировать с окружающими”, — уточняет представитель “Гемотеста”.
О точности диагностики
В России одобрены к использованию десятки тест-систем для выявления коронавируса. Ключевые характеристики — диагностические специфичность (точность) и чувствительность. Первый параметр показывает способность набора определить конкретный вирус. Второй — возможность обнаружить его части, даже если в биоматериале их очень мало. “Чем эти параметры ближе к ста процентам, тем лучше”, — подчеркивает Тамара Силкина.
“Порог чувствительности — общий как для российских, так и для зарубежных тестов: 10³ на миллилитр. То есть должно быть не менее тысячи вирусных геном-эквивалентов на миллилитр образца. “ДНК-технология” заявила о чувствительности 10¹ — десять вирусных единиц на миллилитр. Другой важный показатель — воспроизводимость, то есть возможность получить одинаковый результат в разных условиях. Нужно учитывать и сходимость — отсутствие существенных различий между измерениями, выполненными в одинаковых условиях”, — добавляет медик.
Метод ПЦР с обратной транскрипцией хорошо отработан и практически полностью автоматизирован. С момента попадания в лабораторию анализ занимает четыре-шесть часов. В мире эти тесты буквально поставили на поток. Только в Москве, по официальным данным, сделали 12 миллионов анализов.
Поскольку этот метод прямо выявляет возбудителя в организме, его относят к доказательной медицине и рекомендуют учитывать в клинической практике. Однако анализ больших данных говорит, что при массовом использовании ПЦР-тесты часто промахиваются.
Ложнонегативные результаты получаются в 20-66 процентах случаев. Такие данные из литературы приводят исследователи из Сеченовского университета. Вместе с зарубежными коллегами они Изучили записи пациентов, госпитализированных в университетскую клинику в апреле — мае. Из 3480 человек, чьи ПЦР-тесты были доступны, примерно половина оказались чистыми. В то же время клиническая картина и КТ легких указывали на коронавирусную инфекцию. Авторы допускают, что в реальной клинической практике ПЦР-анализ не столь и критичен.
“Этиологическая диагностика, которая выявляет причину заболевания, нужна априори, — не соглашается Айрат Мавзютов, заведующий кафедрой фундаментальной и прикладной микробиологии, профессор кафедры лабораторной диагностики Башкирского государственного медицинского университета, руководитель Исследовательского центра “Лаборатория”. — При вирусных инфекциях других, сравнимых по чувствительности и специфичности (точности), методов, кроме ПЦР-тестирования, нет”.
Важно понимать, объясняет профессор Мавзютов, что клинический диагноз опирается на субъективные данные — анамнез (опрос) и осмотр пациента. На их основании невозможно установить вирусную природу заболевания и тем более какой именно возбудитель его вызвал. Для этого проводятся лабораторные исследования. Получаемые при этом данные, продолжает ученый, намного объективнее, поскольку большинство современных методов лабораторных исследований автоматизировано. Соответственно, на результаты не повлияют случайные факторы: уровень подготовки специалистов, их настроение, “погода в доме” и так далее.
“Диагноз COVID-19 можно поставить, только когда в материале от больного обнаружили РНК вируса SARS CoV-2 методом ПЦР или же антигены этого вируса иммунохимическими методами. Не выявив следов вируса в организме, нельзя говорить о “ковидной” природе заболевания или летального исхода”, — утверждает Айрат Мавзютов.
Он обращает внимание на еще один аспект. ПЦР-тест не отличает РНК вируса, способного к репродукции, то есть размножению, от обломков “нежизнеспособных” вирусных частиц. Он лишь позволяет понять, присутствует или нет РНК коронавируса в клетках.
“Пока инфицированные клетки не заменятся на новые, а на это уходит от двух до четырех недель, не исключены положительные результаты. При этом вирус может быть уже “мертвым”, человек здоров и никому не опасен”, — отмечает профессор. Для уточнения учитываются данные целого ряда дополнительных исследований, позволяющих на лабораторном уровне оценивать остроту воспалительного процесса или образование антител на стадии его завершения.
Альтернатива ПЦР-диагностике
В любом случае нужно повышать чувствительность тест-систем на основе ПЦР, заключает Алексей Чемерис, а для этого нужны другие подходы. “Надо сделать так, чтобы ложнонегативных результатов было меньше, практически исключить их”, — считает он.
В Обзоре, подготовленном вместе с коллегами, профессор Чемерис рассматривает преимущества и недостатки ПЦР-диагностики и других методов амплификации — копировании РНК бетакоронавирусов, к которым относится SARS-CoV-2. Теоретически весьма перспективен метод петлевой амплификации — LAMP, где используют сразу шесть или восемь праймеров.
“С одной стороны, повышается специфичность: только когда все праймеры отожгутся (сработают, распознав РНК коронавируса. — Прим. ред.), начнется амплификация, с другой — вирус мутирует и шансы, что реакция не пойдет, увеличиваются, поскольку какие бы участки генома ни выбрать, все равно вероятность мутаций больше в восьми участках, чем в двух или трех (при использовании гибридизационного зонда), достаточных для ПЦР”, — объясняет исследователь.
Во время предшествующей эпидемии SARS возбудителя выявляли с помощью реакции NASBA (амплификации на основе секвенирования нуклеиновых кислот) и RCA (репликации по типу катящегося кольца). Геномный редактор CRISPR-Cas также пробуют применять для идентификации РНК нового коронавируса. Есть работы по полногеномному секвенированию любого генетического материала, находящегося в биоматериале. Метод очень чувствительный, но дорогой и долгий — занимает 20 часов. Так что в ближайшее время ПЦР с обратной транскрипцией останется самым массовым способом обнаружения коронавируса в организме.